Osnovni gradniki molekulskih kristalov so molekule. So najobsežnejša oblika kristalov, vanjo sodi večina organskih snovi in mnoge od anorganskih. Posledica šibkih vezi med molekulami so njihove nizke temperature tališč in vrelišč in pri mnogih je opazna velika drobljivost.

Primeri molekulskih kristalov:

jod I2(s)	sladkor C12H22O11(s)
suhi led CO2(s) (vir)	žveplo S8(s)