Osnovni delci spojin so molekule spojin in ioni (več o ionih preberi v sklopu Nastanek ionov).

Molekule nastanejo, ko se dva ali več atomov poveže s kemijsko vezjo. Pri elementih si že spoznal molekule elementov. V tabeli so predstavljene razlike med molekulami spojin in molekulami elementov.

	Molekule elementov	Molekule spojin
Gradniki snovi	So osnovni gradniki določenih elementov.	So osnovni gradniki določenih spojin.
Zgradba molekule	Povežejo se enaki atomi določenega elementa.	Povežejo se različni atomi elementov.
Primer snovi, kemijski zapis in generirani model molekule	vodik H2 kisik O2 dušik N2 klor Cl2 žveplo S8	voda H2O amoniak NH3 ogljikov dioksid CO2 vodikov klorid HCl žveplov dioksid SO2
Slike krogličnih modelov molekul